Άρης και Πανσερραϊκός έχουν συναντηθεί μόλις δύο φορές για θεσμό διαφορετικό από αυτό του πρωταθλήματος και ήταν για το Κύπελλο Ελλάδας την σεζόν 2000/01.
Οι δύο αυριανοί αντίπαλοι για το Κύπελλο Γ΄Εθνικής μετείχαν στον 1ο όμιλο της τότε διοργάνωσης με τον Άρη να μετράει μία νίκη στο ουδέτερο γήπεδο της Καβάλας και μία “λευκή” ισοπαλία στις Σέρρες.
Οι “κίτρινοι” είχαν ολοκληρώσει την φάση των ομίλων με 21 βαθμούς, ενώ η ομάδα των Σερρών με 18. Η πορεία του Άρη στον τότε θεσμό του Κυπέλλου σταμάτησε στην αμέσως επόμενη φάση, όταν και αποκλείστηκε από τον ΠΑΟΚ με ισοπαλία 1-1 στο Χαριλάου και ήττα 2-0 στην Τούμπα.
ΑΡΗΣ – ΠΑΝΣΕΡΡΑΪΚΟΣ 2-0
ΑΡΗΣ: Κατεργιαννάκης, Καραλιόπουλος (60’ Χριστοδούλου), Λουµπούτης (46’ Θεοδωρίδης),Παπαδόπουλος, Κούτσης, Κυζερίδης (46’ Λιολίδης), Μπα, Κυπαρίσσης (82’ Σκέντζος), Μαλλούς(46’ Μάρκος), Χαριστέας (46’ Αγαθοκλέους), Κατσιαρός
ΠΑΝΣΕΡΡΑΪΚΟΣ: Γιαλαµάς, Κατσιούλης, Κύρου, Χατζηνικολάου, Πάττας, Πάβλικ,Αντεµάρ,Μαχαιρίδης (37’ Μουτίδης, 84’ Κατσαβάκης), Μεσέρδης, Τσιφούτης (66’ Αρβανιτίδης), ∆έντσας
Σκόρερς: 80’ Κυπαρίσσης, 90’ Χριστοδούλου
*Στην πρώτη φάση των ομίλων η ΕΠΟ συμφώνησε να γίνονται περισσότερες από τρεις αλλαγές για κάθε ομάδα.
ΠΑΝΣΕΡΡΑΪΚΟΣ – ΑΡΗΣ 0 – 0
ΠΑΝΣΕΡΡΑΪΚΟΣ: Γιαλαµάς, Κύρου, Κατσιούλης, Μεσέρδης, Καρυπίδης (70’ Μουτίδης), Πάττας,∆έντσας, Πάβλικ, Αντεµάρ, Ηλιόπουλος (46’ Μαχαιρούδης), Τσιφούτης (62’ Παναγιωτίδης)
ΑΡΗΣ: Κατεργιαννάκης, Σκέντζος, Κατσιαρός (70’ Λουµπούτης), Παπαδόπουλος, Κολτσίδας,Κυζερίδης (60’ Θεοδωρίδης), Κούτσης, Μπα, Ναγκόλι, Λιολίδης (46’ Κυπαρίσσης), Αγαθοκλέους
