Πραγματοποιήθηκε το μεσημέρι του Σαββάτου, στα γραφεία της ΕΠΟ η κλήρωση του Κυπέλλου Ελλάδας. Ο Άρης θα αντιμετωπίσει τον νικητή της συνάντησης Απόλλων Καλαμαριάς – Καλλιθέα και στη συνέχεια τον νικητή από τα παιχνίδια Αιγινιακού Αιγινίου ή Εργοτέλης – ΠΑΟΚ! Τα παιχνίδια θα είναι διπλά.
Εφόσον παίξει με τον ΠΑΟΚ τα παιχνίδια θα γίνουν τον Ιανουάριο 2013. Τον πρώτο παιχνίδι θα γίνει σε αυτήν την περίπτωση στο Κλεάνθης Βικελίδης και η ρεβάνς στην Τούμπα.
Οι αγώνες της πρώτης φάσης θα ξεκινήσουν το τριήμερο 23-24-25 Οκτωβρίου με τη συμμετοχή των ομάδων της F. L. και F. L. 2 (UPD 13:02-13/10/2012).
Τα ζευγάρια της 1η φάσης: (23, 24 και 25 Οκτωβρίου 2012)
1. Ρούβας – Εθνικός Γαζώρου
2. Αχαρναϊκός – ΑΕΛ
3. Οδυσσέας Κορδελιού – Δόξα Δράμας
4. Κασσιόπη – Αναγέννηση Γιαννιτσών
5. Προοδευτική- Ηρακλής
6. Κόρινθος – Απόλλων Σμύρνης
7. Αναγέννηση Καρδίτσας – Ηρακλής Ψαχνών
8. Χανιά – Φωκικός
9. Καλαμάτα – Θρασύβουλος
10. Επισκοπή – Βύζας Μεγάρων
11. Παναιγιάλειος – Παναιτωλικός
12. Εθνικός Αστέρας – Καλλονή
13. Τηλυκράτης – Καβάλα
14. Πανηλειακός – Παναχαϊκή
15. Βατανιακός – Νίκη Βόλου
16. Ακαδημία Πλαταμώνα – Εργοτέλης
17. Εθνικός Σιδηροκάστρου – Αναγέννηση Επανομής
18. Γλυφάδα – Πανσερραϊκός
19. Δόξα Κρανούλας – Πιερικός
20. Αστέρας Μαγούλας – Ολυμπιακός Βόλου
21. Καλαμαριά – Καλλιθέα
22. Φωστήρας – Ζάκυνθος
23. Τύρναβος – Οικονόμος Τσαριτσάνης
2η ΦΑΣΗ (30, 31 Οκτωβρίου και 1 Νοεμβρίου 2012)
24. Νικητής 20 – Νικητής 12
25. Νικητής 18 – Νικητής 3
26. Νικητής 17 – Νικητής 23
27. Νικητής 9 – Νικητής 10
28. Νικητής 13 – Νικητής 11
29. Νικητής 4 – Νικητής 15
30. Νικητής 22- Νικητής 8
3η ΦΑΣΗ (28, 29 Νοεμβρίου και 12, 13 Δεκεμβρίου 2012 – επαναληπτικοί αγώνες: 19, 20, 22 και 23 Δεκεμβρίου 2012)
31. Πανθρακικός – Νικητής 29
32. Νικητής 28 – ΑΕΚ
33. Ρούβας ή Εθνικός Γαζώρου – Ξάνθη
34. Νικητής 30 – Πανιώνιος
35. Βέροια – Νικητής 27
36. Νικητής 26 – Κέρκυρα
37. ΠΑΣ Γιάννινα – Νικητής 25
38. Ολυμπιακός – Πανηλειακός ή Παναχαϊκή
39. Λεβαδειακός – Δόξα Κρανούλας ή Πιερικός
40. Αιγινιακού Αιγινίου ή Εργοτέλης – ΠΑΟΚ
41. Νικητής 24 – Ατρόμητος
42. ΟΦΗ – Κόρινθος ή Απόλλων Σμύρνης
43. Καλαμαριά ή Καλλιθέα – Άρης
44. Πλατανιάς – Αναγέννηση Καρδίτσας ή Ηρακλής Ψαχνών
45. Αχαρναϊκός ή ΑΕΛ – Αστέρας Τρίπολης
46. Παναθηναϊκός – Προοδευτική ή Ηρακλής
4η ΦΑΣΗ (9, 10, 16 και 17 Ιανουαρίου 2013 – επαναληπτικοί αγώνες: 23,24,30 και 31 Ιανουαρίου 2013)
47. Νικητής 43- Νικητής 40
48. Νικητής 39 – Νικητής 36
49. Νικητής 38 – Νικητής 32
50. Νικητής 46 – Νικητής 44
51. Νικητής 35 – Νικητής 33
52. Νικητής 42 – Νικητής 31
53. Νικητής 37 – Νικητής 34
54. Νικητής 41 – Νικητής 45